青少年白癜风公益活动 https://m-mip.39.net/baidianfeng/mipso_4636741.html本期将主要介绍关于中国人群突变及融合特征分布的新发现。
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MoresomaticmutationscanbedetectedincerebrospinalfluidctDNAofNSCLCpatientswithbrainmetastases
临床意义
肺癌脑转移是临床常见而严重的病情，也是肺癌治疗失败的常见原因之一。非小细胞肺癌患者在病程中约有30%左右发生脑转移。靶向治疗是治疗肺癌脑转移的重要手段，而脑脊液ctDNA更能反映脑部转移灶的突变情况。本研究将分析比较血浆ctDNA和脑脊液ctDNA在检测体细胞突变上的差异，以此评估血浆检测能否作为脑脊液检测的替代方法。
研究内容
总共58例肺癌脑转移患者，同时采集血液样本和脑脊液样本（配对），然后使用OncoPanScan?分别检测其中ctDNA点突变、扩增和融合。总体上看，在脑脊液ctDNA样本中突变检出率要显著高于血浆ctDNA，无论是SNV（81%vs.67.2%）、CNV（19%vs.3.4%）还是基因融合（15.5%vs.8.6%）（图1）；通过Fisher检验发现EGFR、BRAF、NTRK1和TP53在两组样本中突变存在显著差异（Pvalue0.05）。在脑脊液ctDNA和血浆ctDNA中，突变频率前三的基因均是EGFR（67.2%vs.41.4%）、TP53（48.3%vs.27.6%）和LRP1B（19.0%vs.8.6%）。对于EGFR敏感突变LR和Del19，脑脊液ctDNA分别检出19例（32.8%）和14例（24.1%），显著高于血浆ctDNA的11例（19.0%）和7例（12.1%）。对于EGFR耐药突变TM，脑脊液ctDNA检出0例（0%），血浆ctDNA检出5例（8.6%），血浆ctDNA显著高于脑脊液ctDNA，表明脑转移灶与原发灶的耐药情况不同。在脑脊液ctDNA中检出的CNV包括CDK4（4例）、EGFR（4例）、MYC（2例）、RICTOR（1例）、ERBB2（1例）扩增，而血浆ctDNA中仅检出EGFR扩增（2例）和PIK3CA扩增（1例）。另外，在脑脊液ctDNA中检出的常见融合涉及BRAF（3例）、PDGFRA（2例）、ROS1（2例）、ALK（2例）和EGFR（2例），而血浆ctDNA中检出的常见融合涉及RET（3例）、BCR（2例）、EGFR（1例）。综上，在肺癌脑转移患者中，相比于血浆ctDNA，脑脊液ctDNA能检测到更多体细胞突变/扩增/融合，可以为脑部转移灶的靶向治疗提供更全面的用药指导。
图1：脑脊液ctDNA和血浆ctDNA突变图谱对比（包括SNV、CNV和GeneFusion）
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MolecularcharacteristicsofCDK4and/orMDM2amplificationinChinesesofttissuesar
